La universidad tiene una estructura de gobierno constituida por una democracia representativa de todos los claustros, integrada por órganos colegiados y unipersonales de acuerdo con lo previsto en el Estatuto. Además, cuenta con un Rectorado, Vicerrectorado y 7 Secretarías, completando su estructura orgánica funcional con Direcciones, Coordinaciones de Programas y Áreas pertinentes a la gestión institucional.